Олександр Коляда,
генетик

Як відомо, грецька абетка не закінчується буквою дельта. Нові варіанти вірусу як виникали, так і виникатимуть. Один із них – антигерой минулого тижня «Омікрон».

Вперше його було виявлено в зразку, взятому 9 листопада 2021 року в Південній Африці, де останнім часом значно збільшується кількість хворих. Наразі, згідно з даними робочої групи ВООЗ, цей варіант вірусу належить до тих, що викликають побоювання. Це такий певний статут вірусу – якщо він має достатньо потенційно шкідливих властивостей, йому присвоюють це звання. Зараз у цій групі він став п’ятим, після «Альфи», «Бети», «Гами» і «Дельти».

Поки що головне, чим може бути небезпечний новий варіант, це підвищена швидкість передачі. Так, якщо раніше в середньому одна людина заражала півтори людини, то в регіоні ПАР, де зараз спостерігається спалах «Омікрон», у середньому – двох. Ця різниця може здатися незначною, але це може прискорити поширення вірусу.

Це, звісно, не привід для паніки, тому що ми пам’ятаємо історію з мутацією вірусу D614G, який теж поширювався швидше за інших навесні та влітку 2020 року, але не ускладнював перебіг захворювання. Однак зараз зафіксовані випадки, коли вірусом заражаються вакциновані люди (у ПАР основна вакцина – Johnson & Johnson), а це може бути серйознішим. Але такі властивості були й у інших варіантах вірусу. Важливо не те, що він таке вміє, а те, як часто він це робить, тобто який відсоток захисту від цього штаму дає кожна вакцина. А це поки що не відомо. Вірогідність того, що вакцини зовсім не захищають від нового варіанту, дуже низька. Найімовірніше, ми отримаємо зниження ефективності деяких вакцин на якийсь відсоток.

Варіант B.1.1.529 відрізняється від самого першого штаму вірусу з Уханя, про який ми вже встигли забути, великою кількістю мутацій, які виникали та накопичувалися поступово. У спайк-білку, яким вірус кріпиться до наших клітин, новий варіант має аж 32 мутації, кожна з яких може змінювати властивості вірусу. Така кількість генетичних замін могла виникнути через еволюцію вірусу в організмі людини зі зниженим імунітетом, наприклад при СНІДі.

У тілі однієї такої людини вірус може розмножуватися понад 150 днів і за цей час проходити відразу кілька етапів своєї еволюції. Відомий вірусолог з Університету в Йоганнесбурзі, Пенні Мур, каже, що може виявитися, що вірус уникає не лише антитіл, а й Т-клітинної відповіді. Але результатів досліджень ще ніхто не бачив.

Ще раз хочу уточнити: поки ми нічого не знаємо про тяжкість хвороби або особливості перебігу захворювання. Вона може виявитися як зниженою, так і підвищеною. Ось кілька мутацій, які нас насторожують у цьому вірусі і від яких можна чекати неприємностей:

  • Декілька мутацій в RBD- та NTD-доменах дають йому стійкість до антитіл, що нейтралізують.
  • Комбінація H655Y+N679K+P681H у місці розрізання фурином може давати підвищену здатність до проникнення в клітину, а отже, і підвищену швидкість передачі між людьми.
  • Делеція в nsp6 – на зразок делецій в «Альфі» і «Беті» – може бути пов’язана з ухиленням від інтерферонової відповіді і також впливати на швидкість передачі між людьми.
  • Мутації R203K і сусідня G204R в білку нуклеокапсиду, які є в «Альфі», «Гамі» и «Лямбді», можуть подарувати йому і підвищену заразність.

Отже, на сьогодні ми маємо п’ятий потенційно небезпечний варіант, який уже трохи поширився світом і який виявляють не тільки в Африці. У ньому особливо багато мутацій, комбінація яких може призвести до посилення його патогенних властивостей. Є підстави вважати, що він може поширюватися швидше за «Дельту» і їм можуть заразитися вакциновані. Але ми нічого не знаємо про тяжкість викликаного ним захворювання або нові симптоми. Як завжди, потрібні нові дослідження.

 Anywell публікує текст із дозволу автора.
Оригінал